Molekulārā destilācijair īpaša šķidruma-šķidruma atdalīšanas tehnoloģija, kas atšķiras no tradicionālās destilācijas, kuras pamatā ir viršanas temperatūras atšķirības atdalīšanas princips.Šis ir siltumjutīga materiāla vai materiāla ar augstu viršanas temperatūru destilācijas un attīrīšanas process, izmantojot molekulu kustības brīvā ceļa atšķirību augstā vakuumā.Galvenokārt izmanto ķīmijas, farmācijas, naftas ķīmijas, garšvielu, plastmasas un naftas un citās rūpniecības jomās.
Materiāls tiek pārvietots no padeves trauka uz galveno destilācijas iztvaicētāju ar apvalku.Rotora rotācijas un nepārtrauktas karsēšanas rezultātā materiāla šķidrums tiek saskrāpēts ārkārtīgi plānā, turbulentā šķidruma plēvē un spirālveida formā tiek nospiests uz leju.Nolaišanās procesā vieglāks materiāls (ar zemu viršanas temperatūru) materiāla šķidrumā sāk iztvaikot, pārvietoties uz iekšējo kondensatoru un kļūt par šķidrumu, kas plūst uz leju uz gaismas fāzes uztveršanas kolbu.Smagāki materiāli (piemēram, hlorofils, sāļi, cukuri, vaskveida u.c.) neiztvaiko, tā vietā tie ieplūst pa galvenā iztvaicētāja iekšējo sienu smagās fāzes uztvērējkolbā.